23 марта 1994 года создано ФГУП «Авиакомпания „Магаданские авиалинии“» (также известное как «Мавиал»). Предприятие создали путём объединения авиакомпании «Полёт», Магаданского агентства по продаже авиабилетов, наземного комплекса по техническому обслуживанию воздушных судов, медсанчасти, грузовой службы и Центра по подготовке и переподготовке авиаперсонала аэропорта «Магадан-56 км».  

Компания осуществляла авиаперевозки по маршрутам Магадан — Москва, Хабаровск, Владивосток, Иркутск — Екатеринбург — Санкт-Петербург, Новосибирск — Краснодар, Петропавловск-Камчатский, Анкоридж (США). Самолётный парк «Мавиал» состоял из 10 самолетов. Это были среднемагистральные Ту-154, дальнемагистральный Ил-62 и грузовые Ил-76.

Авиакомпания функционировала до 2007 года.